Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc43Q9CR29 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc43Q9CR29 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc43Q9CR29 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms