Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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