Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid1ip1Q9CQ20 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mid1ip1Q9CQ20 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mid1ip1Q9CQ20 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms