Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe41Q99PV5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhe41Q99PV5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms