Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prpf8Q99PV0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf8Q99PV0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms