Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim3Q99PE5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms