Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms