Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clp1Q99LI9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clp1Q99LI9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clp1Q99LI9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120 ms