Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TriobpQ99KW3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TriobpQ99KW3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms