Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nlgn1Q99K10 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nlgn1Q99K10 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms