Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Krcc1Q99JT5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krcc1Q99JT5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms