Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prpf3Q922U1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prpf3Q922U1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms