Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nek8Q91ZR4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms