Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha12Q91Y18 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha12Q91Y18 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms