Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rrp9Q91WM3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms