Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snx15Q91WE1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Snx15Q91WE1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Snx15Q91WE1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snx15Q91WE1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snx15Q91WE1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms