Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Capn8Q91VA3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn8Q91VA3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms