Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG6

Cnot6l, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6lQ8VEG6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnot6lQ8VEG6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot6lQ8VEG6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms