Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCY6

Utp6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp6Q8VCY6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp6Q8VCY6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp6Q8VCY6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp6Q8VCY6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp6Q8VCY6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp6Q8VCY6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp6Q8VCY6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Utp6Q8VCY6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp6Q8VCY6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp6Q8VCY6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp6Q8VCY6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp6Q8VCY6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp6Q8VCY6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Utp6Q8VCY6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp6Q8VCY6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Utp6Q8VCY6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms