Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cdc16Q8R349 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc16Q8R349 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 296.8 ms