Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atg10Q8R1P4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms