Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b4Q8QZY9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sf3b4Q8QZY9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms