Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rassf9Q8K342 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rassf9Q8K342 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rassf9Q8K342 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rassf9Q8K342 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rassf9Q8K342 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms