Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Brd3Q8K2F0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms