Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spire2Q8K1S6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spire2Q8K1S6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spire2Q8K1S6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spire2Q8K1S6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spire2Q8K1S6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Spire2Q8K1S6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Spire2Q8K1S6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spire2Q8K1S6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms