Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
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Card11Q8CIS0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
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Card11Q8CIS0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
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Card11Q8CIS0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
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Card11Q8CIS0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Card11Q8CIS0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Card11Q8CIS0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Card11Q8CIS0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
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Card11Q8CIS0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
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Card11Q8CIS0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Card11Q8CIS0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
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Card11Q8CIS0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Card11Q8CIS0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Card11Q8CIS0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Card11Q8CIS0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Card11Q8CIS0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Card11Q8CIS0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
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Card11Q8CIS0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Card11Q8CIS0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Card11Q8CIS0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Card11Q8CIS0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Card11Q8CIS0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Card11Q8CIS0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
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Card11Q8CIS0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Card11Q8CIS0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Card11Q8CIS0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
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Card11Q8CIS0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Card11Q8CIS0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Card11Q8CIS0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Card11Q8CIS0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Card11Q8CIS0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Card11Q8CIS0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Card11Q8CIS0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Card11Q8CIS0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Card11Q8CIS0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Card11Q8CIS0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Card11Q8CIS0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Card11Q8CIS0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Card11Q8CIS0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
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Card11Q8CIS0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Card11Q8CIS0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
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Card11Q8CIS0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Card11Q8CIS0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Card11Q8CIS0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Card11Q8CIS0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Card11Q8CIS0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
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Card11Q8CIS0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Card11Q8CIS0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Card11Q8CIS0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Card11Q8CIS0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Card11Q8CIS0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Card11Q8CIS0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
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