Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phtf2Q8CB19 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phtf2Q8CB19 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phtf2Q8CB19 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms