Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Spef2Q8C9J3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Spef2Q8C9J3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms