Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cwc22Q8C5N3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cwc22Q8C5N3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cwc22Q8C5N3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cwc22Q8C5N3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms