Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FarsaQ8C0C7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FarsaQ8C0C7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FarsaQ8C0C7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms