Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnrc6bQ8BKI2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Tnrc6bQ8BKI2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tnrc6bQ8BKI2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnrc6bQ8BKI2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms