Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Nop53Q8BK35 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nop53Q8BK35 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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