Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
6820408C15RikQ8BJX2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
6820408C15RikQ8BJX2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms