Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Srgap3Q812A2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srgap3Q812A2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Srgap3Q812A2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srgap3Q812A2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms