Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc50Q810U5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc50Q810U5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms