Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim17Q7TPM3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim17Q7TPM3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms