Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sbno2Q7TNB8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sbno2Q7TNB8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sbno2Q7TNB8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms