Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Rtl1Q7M732 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Rtl1Q7M732 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Rtl1Q7M732 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rtl1Q7M732 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rtl1Q7M732 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rtl1Q7M732 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rtl1Q7M732 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rtl1Q7M732 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rtl1Q7M732 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rtl1Q7M732 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rtl1Q7M732 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Rtl1Q7M732 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Rtl1Q7M732 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Rtl1Q7M732 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms