Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TwistnbQ78WZ7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TwistnbQ78WZ7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms