Protein–RNA interactions for Protein: Q78KK3

Slc22a18, Solute carrier family 22 member 18, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a18Q78KK3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc22a18Q78KK3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc22a18Q78KK3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms