Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed3Q78IS1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed3Q78IS1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms