Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube2r2Q6ZWZ2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms