Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY3

Rps27l, 40S ribosomal protein S27-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27lQ6ZWY3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rps27lQ6ZWY3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps27lQ6ZWY3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms