Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ssxb10Q6XAR7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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Ssxb10Q6XAR7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
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Ssxb10Q6XAR7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Ssxb10Q6XAR7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Ssxb10Q6XAR7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Ssxb10Q6XAR7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxb10Q6XAR7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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