Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Casc1Q6TDU8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Casc1Q6TDU8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casc1Q6TDU8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms