Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJE0

Gfral, GDNF family receptor alpha-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GfralQ6SJE0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GfralQ6SJE0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GfralQ6SJE0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GfralQ6SJE0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GfralQ6SJE0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GfralQ6SJE0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GfralQ6SJE0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GfralQ6SJE0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GfralQ6SJE0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GfralQ6SJE0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GfralQ6SJE0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GfralQ6SJE0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GfralQ6SJE0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GfralQ6SJE0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GfralQ6SJE0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms