Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med16Q6PGF3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med16Q6PGF3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med16Q6PGF3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms