Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc82Q6PG04 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc82Q6PG04 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms