Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrt3Q6PE13 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Prrt3Q6PE13 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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