Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6PD19 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6PD19 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6PD19 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6PD19 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6PD19 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6PD19 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6PD19 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6PD19 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6PD19 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6PD19 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q6PD19 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q6PD19 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q6PD19 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q6PD19 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q6PD19 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6PD19 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6PD19 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6PD19 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6PD19 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6PD19 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6PD19 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6PD19 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6PD19 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6PD19 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6PD19 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6PD19 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q6PD19 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q6PD19 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q6PD19 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q6PD19 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q6PD19 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q6PD19 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q6PD19 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q6PD19 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q6PD19 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q6PD19 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q6PD19 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q6PD19 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q6PD19 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q6PD19 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q6PD19 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q6PD19 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q6PD19 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6PD19 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6PD19 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q6PD19 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6PD19 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6PD19 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6PD19 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6PD19 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6PD19 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6PD19 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6PD19 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q6PD19 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6PD19 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6PD19 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6PD19 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6PD19 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6PD19 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6PD19 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6PD19 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6PD19 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6PD19 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6PD19 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6PD19 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6PD19 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q6PD19 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6PD19 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6PD19 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6PD19 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6PD19 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6PD19 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6PD19 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6PD19 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6PD19 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6PD19 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q6PD19 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q6PD19 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q6PD19 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q6PD19 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q6PD19 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q6PD19 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q6PD19 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q6PD19 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q6PD19 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q6PD19 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q6PD19 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6PD19 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6PD19 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6PD19 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6PD19 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6PD19 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6PD19 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6PD19 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6PD19 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6PD19 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6PD19 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6PD19 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q6PD19 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.6 ms